南京玄奘寺又称慈恩寺，位于南京市栖霞区慈恩寺路，是中国佛教净土宗七祖惠能禅师的亲传门人玄奘抵达长安后创办的寺庙之一。
玄奘寺的历史可追溯至公元401年南朝宋武帝永初元年，此时，江南佛教正在兴盛，为适应南京的佛教需求，南朝宋武帝下令在当前即玄奘寺所在地修建“仙鹤华林寺”。历史上，因寺庙极为庞大，被称为“华林寺城”。
玄奘寺曾多次遭受兵乱和火灾的袭击，经历多次的毁坏和重修，至今仍保留大量的文化遗产。其中著名的古刹包括精舍、大雄宝殿、脚底观音、魏明殿等，均有名家题刻以示千古传承。
近年来，南京玄奘寺注重文化交流，每年都会与国内外各地的佛教团体举办各种活动交流，致力于促进中外佛教的交流结合，为增进世界和平做出贡献。