质粒转染是将外源DNA导入靶细胞内的过程，是基因工程技术中非常重要的一部分。质粒转染技术可以应用于基因编辑、基因治疗、转基因等领域。
在基因编辑中，质粒转染技术主要用于CRISPR-Cas9系统。实现CRISPR-Cas9基因编辑分为两个步骤，第一步是设计引物，组成RNA复合体；第二步是将这个复合体导入到目标细胞内。而质粒转染技术便是用来完成第二步的重要方法。
质粒转染技术还可以用于基因治疗。将治疗基因载入质粒后，通过转染技术将质粒导入到病人的细胞内，从而实现基因治疗。欧洲“儿童脑瘫治疗临床试验”成功将CDKL5基因载入质粒，并通过质粒转染技术导入受试者细胞内，迅速被学界报道。
质粒转染技术是目前基因编辑和基因治疗中重要的工具之一，对于发展基因治疗、转基因等领域起到了重要作用。